در زمان جنگ‌های منطقه‌ای در ژاپن، ارباب دایگو کاگه میتسو قردادی با 12 شیطان میبندد تا در ازای نوزاد متولد نشده‌اش، رفاه و آسایش را به سرزمینش تقدیم کنند. نوزاد ناقص متولد شده در رودخانه رها می‌شود. در حالیکه قلمرو کاگه میتسو به رونقی که وعده‌اش داده شده بود دست میابد. سالها بعد، "دورورو" دزد جوان با "هیاکیمارو" مرموز روبرو می‌شود، پسری که به جای بازوانش تیغه‌های شمشیر قرار دارد و چشمان نابینایش به نظر می‌رسد که قادر به دیدن هیولاهاست.

“موگن” يک جنگجوي وحشي، خشن، بي‌کله است. “جين” يک سامورايي آواره، مرموز، سنتي، خوش‌مرام و البته بسيار قدرتمند است. اين دو جنگجوي تندخو و مستقل، زمين تا آسمان با هم تفاوت دارند، اما از قضاي روزگار راهشان با يکديگر تلاقي مي‌کند و اين زماني اتفاق مي‌اُفتد که “فو” ، پيشخدمتي سربه‌هوا و مزاحم،‌ آنها را پس از دستگيري بخاطر مبارزه خشونت‌بار با شمشير، از اعدام نجات مي‌دهد. “فو” اين دو جوان سرگردان را متقاعد مي‌کند تا براي يافتن يک سامورايي اسرارآميز کمکش کنند؛ «سامورايي‌اي که بوي گلهاي آفتابگردان مي‌دهد» ؛ و اين‌گونه سفرشان آغاز مي‌شود.

زندگي در ژاپن فئودال آسان نيست... خصوصا حالا که فضايي‌ها آمده و همه‌ چيز و همه‌ جا را به تصرف خود درآورده‌اند! خب البته، اوضاع بيمه و بهداشت عالي شده، اما ممنوعيت عمومي استفاده از شمشير، بسياري از سامورايي‌هاي شکست‌خورده را با تصميم سختي رو‌به‌رو ساخته که همانا انتخاب مسير زندگي آينده‌شان است! اين موضوع، خصوصا در مورد افرادي از جمله گينتوکي ساکاتا صدق مي‌کند که به شغل درازمدت و منظمي پايبند نيستند. اين شد که گينتوکي، دنبال شغل آزاد رفته و هر کاري به او پيشنهاد شود، مي‌پذيرد، البته تا جايي که حقوق آن به اندازه‌ي کافي باشد. اما چه مي‌شود کرد که در اين دنياي تازه که پر از هيولاهايي با چشم‌هاي حشره‌ مانند، ياکوزايي که روز به روز پيشرفت مي‌کند و جاه‌ طلبي‌هاي بي حد و حصر فضايي‌هاست، هيچ کاري آن‌قدر که رنج و درد و بدبختي براي گينتوکي به همراه مي‌اورد، پول چنداني عايدش نمي‌کند!

برای گابیمارو، نینجای اهل دهکده ایواگاکوره که به بی احساس بودنش معروفه، توسط دوستش پاپوش دوخته شده و الان براش حکم اعدام بریدن. گابیمارو که از قتل و خیانت خسته شده، میخواد بمیره. ولی هیچ روش اعدامی نمیده، چون علیرغم جوری که به نظر میرسه، هنوز دلیلی برای زندگی کردن داره. میخواد برگرده پیش همسرش که به خاطرش نرم شد و توی قاتل بودن شکست خورد. برای همین مرگ رو رد میکنه. آسائمون، یه جلاد معروف، این رو میبینه و به نینجا یه پیشنهاد میده. از گابیمارو میخواد که به جزیره ای در جنوب ژاپن اعزام بشه و به دنبال اکسیر زندگی بگیره، در ازای عفو کامل شوگان. با اینحال، اون جزیره یه جزیره عادی نیست. گفته میشه که بهشته. این جزیره پر از رمز و رازه و تیم کاوش-که از کسایی که حکم اعدام دارن تشکیل شده- ممکنه کامل براش آماده نباشن.

گینتوکی برای کوتاه کردن موهایش به آرایشگاه مراجعه می کند. پس از اینکه کاگورا اشاره می کند که جلد هفتم مانگای ابو مفقود است، آرایشگر برای خریدن جلد فرار می کند و یوروزویا را با مغازه اش تنها می گذارد! پس از مدتی کاتسورا و کوندو و شوگان وارد مغازه می شوند و می خواهند در کوتاه کردن مو بقیه کمک کنند. یوروزویا دچار ناامیدی می شود زیرا آنها حتی نمی دانند چگونه موها را به درستی کوتاه کنند...

شیمازو تُیُهیسا کیست، که درگیر جنگ سکیگاهارا میشود و زخم مهلکی از نائُماسا میخورد و همان طور که شکست خورده در جنگ و با خونریزی زیاد در میدان پر از کشته راه میرفت خودش را در مقابل در و راهرویی می بیند و مردی که پشت یک میز منتظر اوست اسمش موراساکی است کسی که تُیُهیسا را از طریق همان در به دنیای دیگری می فرستد. تُیُهیساوقتی از خواب بیدار می شود جنگجویان بزرگی را می بیند که مانند او منتقل شدند و در قالب گروهی به اسم سرگردانان قرار گرفته اند. ولی این گروه چه وظیفه ای دارد؟ چه سرنوشتی در انتظار تُیُهیسا و دیگران است ؟

پس از یک وقفه یک ساله، شینپاچی شیمورا به ادو باز می گردد، اما با یک شگفتی تکان دهنده مواجه می شود: گینتوکی و کاگورا، اعضای همکار او یوروزویا، به شخصیت های کاملاً متفاوتی تبدیل شده اند! شینپاچی گیج و سردرگم از مقر یوروزویا فرار می کند و متوجه می شود که همه ساکنان ادو دستخوش تغییرات غیرممکن، هم در ظاهر و هم در شخصیت شده اند. باور نکردنی تر اینکه خواهرش اوتائه با رئیس شینسنگومی (شکارچی بی شرم ایسائو کوندو) ازدواج کرده و اولین فرزندشان را باردار است.